O serviço é composto por profissionais com formação específica em cardiopatias congênitas, operando juntamente com o Serviço de Hemodinâmica do Hospital de Base. Os exames diagnósticos e terapêuticos são previamente agendados e realizados após discussão clínica. Realiza exames de urgência e, quando necessário, procedimentos à beira do leito, como atriosseptostomias com balão de Rashkind, em conjunto com o Serviço de Ecocardiografia.